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Single Cell Sequence Specific Amplification Kit

貨號 22121 售價(元) 2150
規(guī)格 200 rxn CAS號
  • 產(chǎn)品簡介
  • 相關(guān)產(chǎn)品

產(chǎn)品描述

        Single Cell Squence Specific Amplification Kit是基于一步RT-PCR的預(yù)擴增方法,適用于單細胞或者微量總RNA中轉(zhuǎn)錄組的擴增,便于進行單細胞轉(zhuǎn)錄組表達差異的分析。本試劑盒實現(xiàn)了RNA提取純化、逆轉(zhuǎn)錄和PCR預(yù)擴增反應(yīng)在同一管內(nèi)完成,不需要額外的操作,簡單高效,還能減少實驗誤差和污染風(fēng)險。除了應(yīng)用于單細胞,本試劑盒亦可適用于2~1,000個細胞的一步擴增,應(yīng)用時僅需按照細胞數(shù)目減少一步擴增的循環(huán)數(shù);獲得的擴增產(chǎn)物適合于任何實時熒光定量PCR分析法。染料法和探針法qPCR分別推薦ToloBio通用型2 × Q3 SYBR qPCR Master Mix (Universal, #22204)和2 × Q3 probe qPCR Master Mix (Universal, #22205)。

 產(chǎn)品優(yōu)勢

一步法RT-PCR預(yù)擴增:細胞裂解、RNA逆轉(zhuǎn)錄和PCR擴增在同一管內(nèi)完成,不需要額外的移管操作。
一次可擴增500個靶基因:擴增產(chǎn)物適合用任何實時熒光定量PCR儀分析。

 實驗案例

        分別使用ToloBio #22121與競品Supplier A、Supplier B,對不同濃度的小鼠巨噬細胞進行一步法RT-PCR預(yù)擴增,產(chǎn)物進一步qRCR(ToloBio #22204)擴增,比較在相同引物和相同細胞個數(shù)條件下的擴增情況,包括擴增靈敏度、擴增線性和擴增平臺。結(jié)果顯示,ToloBio #22121在不同濃度細胞(1~1000個細胞/test)條件下擴增性能穩(wěn)定、優(yōu)異。

 實驗流程

1.Primer Pool的制備
        將不同待測基因的擴增引物進行混合,制備成Primer Pool,使各引物的終濃度為0.1 μM。以Bcl-2基因為例,其上、下游引物原濃度均為100 μM,則應(yīng)各取1 μL加入998 μL RNase-free ddH2O至終體積為1 mL。多個基因引物對的制備依此類推,最多可混合500對不同基因的擴增引物。

2.預(yù)擴增反應(yīng)體系
        在RNase-free離心管中冰上配制如下反應(yīng)體系:

組分

       體積

2 ×Tolo scAmp Reaction Buffer 

       2.5 μL

Primer Pool (0.1 μM)

       0.5 μL

RT/Taq Enzyme Mix

       0.2 μL

Cell sample a

      0.5~1 μL

RNase-free ddH2O

Up to 5 μL

a.細胞可儲存于PBS緩沖液中。
以上體系(除細胞樣本外)充分混勻后冰上放置備用,可加入1~1000個細胞樣本。為了使細胞充分破碎,將加入細胞樣本的完整體系置于-80℃冰箱2 min,隨后3,000 rpm (1,000 × g)室溫或4℃離心2 min,然后立即放入PCR儀進行如下反應(yīng):

程序

溫度

時間

循環(huán)數(shù)

反轉(zhuǎn)錄

50℃

60 min

1 cycle

預(yù)變性

95℃

3 min

1 cycle

循環(huán)反應(yīng) b

 

95℃

15 sec

20 cycles

 

60℃

15 min

Hold

4℃

-

-

b.建議循環(huán)數(shù)隨起始細胞數(shù)量作相應(yīng)調(diào)整:1個細胞20個循環(huán),10個細胞17個循環(huán),100個細胞14個循環(huán),1,000個細胞11個循環(huán)。 
反應(yīng)結(jié)束后,每管加入20 μL RNase-free ddH2O (1:5稀釋),用移液器吹打混勻,室溫短離集于管底??闪⒓催M行后續(xù)qPCR定量反應(yīng)或-20℃短期保存。

3.qPCR反應(yīng)體系
冰上配制如下反應(yīng)體系:

組分

       體積

2 × Q3 SYBR qPCR Master Mix (Universal,#22204) 

        10 μL

Primer F (10 μM)    

        0.5 μL

Primer R (10 μM)

        0.5 μL

Template DNA c

        1 μL

ddH2O

  Up to 20 μL

c.為減少加樣誤差,建議將1:5稀釋的預(yù)擴增產(chǎn)物再稀釋10倍后使用。

以上體系充分混勻后,短暫離心集于管底,隨后立即放入qPCR儀進行如下反應(yīng):

Stage

程序

溫度

時間

         循環(huán)數(shù)

Stage 1

預(yù)變性

95℃

5 min

          1 cycle

Stage 2

 

循環(huán)反應(yīng)

 

95℃

10 sec

 

        40 cycles

 

60℃ 

30 sec

Stage 3

熔解曲線

儀器默認程序

 

           1 cycle

 產(chǎn)品組成

組分        

22121 (200 rxns)

 2 × Tolo scAmp Reaction Buffer d

500 μL

 RT/Taq Enzyme Mix e

40 μL

○ RNase-free ddH2O

2 × 1 mL

d.包含 dNTP;
e.包含RTase、RNase inhibitor和Taq DNA polymerase;

保存條件

-20℃保存,≤ 0℃運輸;

 

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